Une variante née en Californie qui s’est largement répandue dans la majeure partie de l’État depuis le début de l’année semble être plus contagieuse que les autres versions du coronavirus, et peut également provoquer une maladie plus grave et quelque peu résistante à la réponse immunitaire du corps, selon deux études publiées lundi.
À la fin du mois de janvier, la variable représentait plus de la moitié des cas analysés par les scientifiques de l’UCSF dans une étude, qui examinait les données de 44 des 58 comtés de Californie, y compris les neuf comtés de la région de la baie. Pas plus tard qu’en septembre dernier, une variante était rare, représentant moins de 1% des cas.
Les deux études, de l’Université de Californie à San Francisco et de l’étude Chan Zuckerberg BioHub, sont les premières à montrer que la soi-disant variante californienne se propage plus facilement que d’autres et présente d’autres caractéristiques inquiétantes. Les scientifiques avaient soupçonné que la variante était plus contagieuse en raison de la rapidité avec laquelle elle a explosé dans certaines parties de l’État et du fait qu’elle était liée à plusieurs grandes épidémies, mais ils manquent de preuves solides jusqu’à présent.
Les scientifiques de Chan Zuckerberg Biohub et UCSF ont examiné les résultats des tests positifs dans le district de Mission et ont constaté qu’environ 35% des membres de la famille avaient contracté l’infection lorsqu’un cas de la variante californienne était ramené à la maison; Le taux d’attaque pour les autres variantes était d’environ 26%.
Par ailleurs, une étude du Dr Charles Chiu de l’Université de Californie à San Francisco a également trouvé des preuves que la variante est plus contagieuse. De plus, son équipe a constaté que les personnes atteintes de la variante étaient plus susceptibles de se retrouver en soins intensifs ou de mourir. Des tests en laboratoire ont montré que la variable était moins sensible aux anticorps produits par des personnes qui avaient été précédemment infectées. Il n’était pas clair d’après les résultats si la variante était moins sensible aux vaccins.
« Il est probable qu’elle sera classée comme un type différent d’anxiété qui justifie un suivi urgent », ont écrit Qiu et une équipe d’auteurs dans un article sur l’étude. Les deux études n’ont pas encore été publiées.
Ce n’est pas aussi agressif que la variante britannique. On pense que la variante britannique, connue sous le nom de B.1.117, est environ 50% plus contagieuse que « Le virus d’origine est de Chine. Mais cela souligne la nécessité d’examiner cette souche plus attentivement. et mener plus d’études à ce sujet. Nous devons nous rendre compte qu’il existe dans la communauté et qu’il se propage rapidement. «
Malgré cela, Chiu a déclaré qu’une étude plus approfondie pourrait en fait montrer que la variante en Californie est aussi contagieuse que le type trouvé au Royaume-Uni.
« Cette alternative doit être traitée avec le même niveau de préoccupation que les autres variables », a déclaré Qiu dans une interview lundi. « Je suis en fait très préoccupé par cette espèce particulière. C’est essentiellement la majorité des cas actuellement en Californie. »
Les variantes de coronavirus deviennent une préoccupation croissante dans l’épidémie, car des versions mutées du virus apparaissent dans le monde entier qui sont plus contagieuses, provoquent une maladie plus grave ou sont partiellement résistantes aux vaccins. Les responsables de la santé publique se précipitent pour immuniser partiellement de grandes parties du pays afin de réduire les cas et d’empêcher la mutation du virus.
Les experts en maladies infectieuses se sont inquiétés pour la première fois de la variante californienne en janvier, lorsque deux équipes de scientifiques – une à l’Université de Californie à San Francisco et l’autre à Los Angeles – ont déterminé qu’elle se propageait rapidement dans quelques communautés, dont certaines dans le Région de la baie. La variante s’est avérée être à l’origine d’une épidémie majeure à Kaiser Permanente à San Jose, où plus de 90 personnes ont été infectées.
Il y a eu une certaine confusion sur ce que l’on pourrait appeler une variante californienne, et ce sont en fait deux espèces distinctes mais très similaires qui partagent les mêmes mutations majeures. Le département de la santé publique de Californie les appelle B.1.429 et B.1.427, mais les deux variantes sont également appelées CAL.20C ou parfois appelées une seule mutation, L452R.
Cette mutation est la clé de la variable California. Il est situé sur la protéine de pointe – l’endroit du virus où il entre en contact avec les cellules humaines. En raison de l’emplacement, on pense que la mutation L452R rend le virus plus capable de se fixer aux cellules humaines, ce qui rend le variant plus contagieux.
L’étude Chiu a utilisé plusieurs techniques pour examiner l’étendue de la variante contagieuse de la Californie et si elle provoque une maladie plus grave ou peut être résistante à une réponse immunitaire, soit d’une vaccination, soit d’une infection antérieure.
Son équipe a constaté que la variante semblait se propager plus rapidement lors d’épidémies. De plus, le virus était plus concentré dans des échantillons prélevés sur des individus infectés par le variant. Les deux sont des signes d’une infection accrue. Les scientifiques ont également constaté que la variante était plus contagieuse dans les études de laboratoire.
La recherche a également montré que la variable était associée à un risque plus élevé d’être placé sous respirateur, d’un traitement en soins intensifs et de décès. Mais Qiu a déclaré que le nombre de cas à l’hôpital examinés par son équipe était relativement faible et que des études supplémentaires étaient nécessaires pour confirmer que le substitut provoque une maladie plus grave.
L’équipe a également examiné la réponse immunitaire contre la variante par des personnes qui avaient été vaccinées ou qui avaient déjà été infectées par le coronavirus. Le variant était résistant à certains anticorps des deux groupes – un signe que les vaccins pourraient être quelque peu affaiblis et que les gens pourraient être à nouveau susceptibles d’être infectés par le variant.
Mais Qiu a dit qu’il croyait que les vaccins seraient toujours efficaces. «En général, les réponses vaccinales sont très fortes», a-t-il déclaré.
La recherche sur le district de mission a été coordonnée par Unidos en Salud, une collaboration entre Chan Zuckerberg Biohub, UCSF, le Département de la santé publique de San Francisco et le groupe de travail Latin COVID-19. Le groupe gère un site de test accéléré des coronavirus dans le district de Mission depuis août, et des scientifiques ont travaillé avec la communauté pour signaler comment le virus s’y est propagé.
Deryce a noté que des recherches supplémentaires sont nécessaires pour déterminer dans quelle mesure la variante est contagieuse et dans quelles conditions. Il a déclaré que ces nouvelles preuves devraient rappeler aux gens d’être « un peu plus prudents » dans la prévention des infections, même si les cas continuent de baisser.
« Même s’il est bon que le taux de positivité diminue très rapidement et que tout le monde encourage un vaccin, cela ne signifie pas que nous devons assouplir nos mesures de protection maintenant. Parce que ce sont des choses qui pourraient se propager plus rapidement et potentiellement avoir des avantages, même en un individu qui a été quelque peu vacciné. « Ce n’est pas le moment de baisser la garde. »
Pour l’étude de la mission, les scientifiques ont effectué près de 8900 tests du 10 au 27 janvier. Environ 800 tests positifs sont arrivés et les scientifiques ont séquencé génétiquement environ 630 des échantillons positifs. Ils ont constaté que le substitut californien représentait 53% des échantillons – une augmentation significative par rapport au dernier lot de séquences de gènes dans la tâche avant Thanksgiving, lorsque le variant ne représentait que 16% des échantillons.
Ensuite, des scientifiques et des responsables de la santé publique ont enquêté sur les cas positifs pour déterminer comment la variante se propageait dans les foyers de la mission. Le taux d’attaque à domicile est un moyen courant de déterminer l’étendue d’une infection virale.
Les scientifiques ont trouvé plusieurs autres mutations potentiellement dérangeantes dans les résultats de l’expédition, dont une personne infectée par une variante du Brésil appelée P.2. Cette variante n’est pas l’inquiétante P.1 qui s’est largement répandue dans certaines parties de ce pays, mais la variante P.2 porte une mutation qui peut la rendre partiellement résistante aux vaccins. Derezi a déclaré qu’une personne infectée par la variante ne semblait l’avoir transmise à personne d’autre.
L’équipe n’a trouvé aucune variante du Royaume-Uni ou d’Afrique du Sud, qui ont toutes deux été identifiées dans d’autres parties de l’État.
DeRisi a déclaré que, loin d’étudier la mission, Biohub a identifié plus tôt ce mois-ci une nouvelle variable dans l’épidémie des maisons de retraite dans le comté de Humboldt. Cette variante a une mutation présente dans d’autres variantes connues pour rendre le virus plus contagieux. Mais la mutation semble être apparue au hasard dans la maison de retraite, ont déclaré des responsables de la santé publique.
« Les variables du coronavirus apparaîtront tout le temps. C’est toujours une question sur les variables auxquelles je devrais prêter attention. Laquelle est importante », a déclaré Deryce. « Chaque mutation que vous mettez sur le tableau de votre leader et que vous avez regardé. »
Irene Alday est écrivain pour le San Francisco Chronicle. Courriel: [email protected] Twitter: Intégrer un Tweet
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